Основной деятельностью научно-исследовательского отдела «История края» является научно-исследовательская работа. Цель отдела — пополнение музейного фонда ценными экспонатами, относящимися к истории и культуре края, их изучение и проведение научно-просветительской деятельности. Научно-исследовательская работа: Научно-исследовательская деятельность ведётся по следующим направлениям: – изучение ценных экспонатов музейного фонда; – разработка научных концепций музея; – научное описание экспонатов фонда музея, проведение работ по научному изучению и эффективному использованию через автоматизированную информационную систему "АС-Музей" в рамках государственной программы "Цифровой Казахстан" с целью преобразования музейных коллекций в цифровые данные для повышения их доступности. Научные статьи сотрудников публикуются в сборниках научно-практических и научно-познавательных конференций, а также в средствах массовой информации. Кроме того, отдел занимается изданием каталогов экспонатов. Экспедиционная деятельность: сотрудники ежегодно занимаются сбором музейно- значимых экспонатов, связанных с историей и культурой края. Научно-просветительская работа: сотрудники отдела проводят в научно-просветительских, образовательных учреждениях специальные познавательные лекции, открытые уроки, совещания, передвижные выставки, круглые столы, научные конференции и семинары, посвященные истории и культуре края. Выставочная деятельность: разрабатываются концепции и организуются историко-познавательные выставки, посвящённые истории и культуре края. Работа по комплектованию: сбор новых ценных экспонатов, их исследование по итогам научных экспедиций и введение в научный оборот, организация научных экспедиций и служебных поездок. Проекты: в настоящее время одним из вопросов, стоящих на повестке дня, является всестороннее образование подрастающего поколения на уровне XXI века. В этой связи, посредством научно-образовательного проекта "Юный краевед" с инициативной молодежью учебных образовательных учреждений города проводится пропаганда по вовлечению их в изучение истории нашего края, национальных историко-культурных ценностей, повышение интереса молодежи к музею. То есть молодые исследователи из числа жителей Кызылординской области собирают ценные экспонаты музейного значения, относящиеся к истории и культуре страны, дают им научную характеристику и представляют полные научные сведения. В рамках проекта «География сакральных мест Казахстана» организуются историко-познавательные экскурсии «SACRAL TOUR» к памятникам историко-культурного наследия, включённым в общенациональный список священных мест Кызылординской области. Впервые общественности представлен проект «Энциклопедия музея», посвящённый жизни и деятельности известных личностей области, работавших в различных отраслях. Также ведётся популяризация ценных, ранее не исследованных материалов 1975–1985 годов в сферах образования, здравоохранения, спорта и культуры через социальные сети. Познавательный проект «Кто жил в этом доме». Город Кызылорда в 1925–1929 годах был столицей Казахской АССР. После объявления города столицей в нашу область начали съезжаться представители казахской интеллигенции (Сакен Сейфуллин, Бейимбет Майлин, Ильяс Жансугуров, Сабит Муканов и др.). В настоящее время установлены дома, в которых проживали и работали выдающиеся представители казахской интеллигенции, советской литературы, Герои Социалистического Труда, деятели культуры и искусства, государственные и общественные деятели (Е. Ауельбеков, Г. Мухамеджанов, Т. Есетов и др.), и на них установлены памятные таблички. Однако не все знают об этих страницах истории. Данный проект направлен на популяризацию истории жилых домов, связанных с именами известных личностей, со временем утрачивающих свой образ, а также на освещение жизненного пути и деятельности этих людей.

Отдел осуществляет археологические и этнографические исследования, экспертизу и документирование ценных экспонатов научного фонда музея, формирование выставочных экспозиций по археологической и этнографической тематике. Сотрудники организуют археологические и этнографические экспедиции, участвуют в раскопках историко-культурных памятников области и регистрации археологических находок. Кроме того, одним из основных направлений работы является проведение научных исследований в области этнографии, систематизация собранных материалов и формирование обоснованных выводов с последующей передачей их в музейный фонд, организация этнографических экспедиций на территории области по теме «Полевые экспедиции и эмпирические исследования на земле Сыра», подготовка выставок и экспозиций на различные темы, проведение культурных мероприятий и познавательных занятий. Сотрудники отдела организуют встречи с учёными-этнографами и мастерами народных ремёсел, проводят научно-практические конференции. Также деятельность отдела дополняется публикацией научных статей и интервью в средствах массовой информации, а также организацией совместно с местными телеканалами телепроектов, направленных на популяризацию казахских традиций и обычаев. Отдел обеспечивает экскурсионное сопровождение археологических и этнографических экспозиций, формируя интерес к истории, пропагандируя национальные ценности и повышая духовную культуру населения. Сотрудники участвуют в археологических раскопках древних и средневековых городищ (Чирик-Рабат, Кескен-Куйык, Жанкент, Асанас, Сортобе, Кышкала, Сыганак), проводят этнографо-фольклорные экспедиции и пополняют музейный фонд. В настоящее время в рамках программы «Рухани жаңғыру» с целью возрождения школьного туризма по проекту «География сакральных мест Казахстана» отдел организовывает историко-познавательные экскурсии «SACRAL TOUR» к историко-культурным памятникам, включённым в общенациональный список сакральных объектов Кызылординской области. В рамках программной статьи Президента «Семь граней Великой степи», раздела «Модернизация исторического сознания», реализуется проект «VILLAGE LIFE», направленный на знакомство городской молодёжи с сельской жизнью, животноводством, культурой верховой езды, возрождение в подрастающем поколении забытых слов, связанных с сельским хозяйством, а также популяризацию национальных обычаев и традиций. В связи с объявлением 2019 года Годом молодёжи и в рамках программной статьи «Семь граней Великой степи» отдел «Археология и этнография» реализует среди школьников видеопроект «Будущий экспонат» с целью передачи в музейный фонд ценных (материальных и нематериальных) экспонатов. Видеоматериалы, размещённые на YouTube-канале Кызылординского областного историко-краеведческого музея, стали источником исторической информации для широкой аудитории. К 750-летию Золотой Орды сотрудниками отдела был организован тимбилдинг «Археологический микромир», в рамках которого молодёжи предоставлена возможность рассматривать археологические находки под микроскопом и участвовать в научно-исследовательской деятельности. В 2020 году в рамках программ «Рухани жаңғыру» и «Семь граней Великой степи» был организован телепроект «Асыл мұра» на местном телеканале «Qogam TV» с использованием современных технологических методов популяризации археологических и этнографических экспонатов. С 2021 года в целях развития музейной журналистики, освещения деятельности музея, проведения интервью с учеными и друзьями музея реализуется проект «Музейное радио», включающий теле- и радиопередачи в видео- и аудиоформате, в том числе в формате подкастов. Сотрудники отдела активно сотрудничают с областными телеканалом «Қазақстан–Қызылорда», принимая участие в программах «Таңғажайып табиғат», «Жаңа күн», «Қызылорда музейлері», «Үш таған», где делятся информацией о деятельности музея и истории ценных экспонатов музейного фонда. Также налажено тесное взаимодействие с республиканским телеканалом «Мир» и местным телеканалом «Қоғам TV».

Основная ценность любого музея определяется богатством его фондов. В фонде Кызылординского областного историко-краеведческого музея хранятся ценности материальной и духовной культуры, отражающие историю края с древнейших времён до современного периода. Основная деятельность всех научных подразделений музея тесно связана с музейным фондом и направлена на учёт, хранение, научную регистрацию, систематическое пополнение, научную паспортизацию и исследование музейных предметов. Главная задача фондового отдела — пополнение и учёт музейного фонда, научное изучение, обработка и описание музейных предметов, их маркировка, организация условий хранения, проведение инвентаризации и проверок. Структура и состав музейного фонда включают основной и вспомогательный фонды. В основном фонде сосредоточены ценные музейные предметы, имеющие историческое значение: фото- и документальные материалы, археологические находки, обнаруженные в ходе раскопок, нумизматические материалы, этнографические и ювелирные изделия, оружие, произведения изобразительного искусства. Во вспомогательный фонд входят копии предметов, экспонаты с неудовлетворительным состоянием сохранности, а также предметы, имеющие дубликаты в музейном собрании. Общий фонд музея составляет 65 939 экспонатов (10.07. 2024 г.), из них 39 007 единиц основного фонда и 26 932 единицы вспомогательного фонда. Экспонаты, собранные в фондах музея, распределены по коллекциям в соответствии с классификацией, типами источников и материалами, а именно: • археология; • фотодокументы; • нумизматика (бумажные деньги и монеты); • книги и рукописи; • этнография (изделия из дерева, металла, шерсти, посуда, ювелирные украшения, одежда и др.); • скульптура; • живопись; • музыкальные инструменты; • нагрудные знаки (ордена, медали); • изобразительное искусство (скульптура, картины); • редкие книги и рукописи; • оружие (конская упряжь, различные виды вооружения). Учёт, научная регистрация и пополнение фондов: Учёт музейных фондов является одним из основных направлений фондовой работы. Все музейные предметы и коллекции подлежат государственному учёту. Учёт музейных предметов и коллекций включает их идентификацию, организацию хранения, определение местонахождения, контроль состояния сохранности, проведение научных исследований и регистрацию в специальных учётно-хранительских документах с целью рационального и эффективного использования. Государственный учёт фонда музея осуществляется в два этапа: первичный учёт новых поступлений и научная регистрация музейных предметов. Систематическое пополнение фондов является одним из ключевых научных направлений музейной деятельности. Фонды музея пополняются различными путями. Основными источниками поступлений являются дарения организаций и частных лиц, закупка у физических лиц, а также предметы, полученные в результате комплектования и проведения археологических, этнографических, исторических и естественнонаучных экспедиций, организованных для изучения специальных тем и сбора данных. Реставрационные работы: Реставрационная деятельность направлена на систематическое изучение новых технологий и поиск оптимальных решений в восстановлении музейных предметов. С момента поступления в музейные коллекции экспонаты находятся под постоянным контролем сотрудников фондового отдела. Сбор музейных предметов, их систематизация, учёт коллекций и обеспечение сохранности – все это начинается с музейной работы. В задачи отдела также входит оформление актов состояния сохранности экспонатов, вывозимых за пределы музея, постоянная работа с картотеками (авторскими, общими и рабочими), фотосъёмка экспонатов, составление описаний, комплексная подготовка выставок к выездной экспозиции, а также ведение общего музейного каталога.